Le thésaurus INRAE, une nouvelle ressource pour l’Institut

En mars 2021, le thésaurus INRAE est entré en service !

Le thésaurus INRAE est un thésaurus ouvert et partagé couvrant les domaines de recherche d’INRAE avec plus de 15 000 concepts en français et en anglais. Il est le fruit d’un travail collectif de plusieurs mois pour fusionner et réorganiser les concepts du thésaurus Irstea et les mots-clés INRAE.

Le thésaurus INRAE est structuré en 12 grands domaines thématiques

La vocation du thésaurus INRAE est de servir de référentiel commun pour :

  • indexer, annoter les contenus textuels : publications dans HAL INRAE (déjà opérationnel, en savoir plus), pages web, etc. ;
  • indexer, annoter des jeux de données : dans Data INRAE avec le champ Keyword par exemple ;
  • trouver des termes en français et en anglais pour désigner les principaux objets d’intérêt et méthodes scientifiques d’INRAE. 2/3 des concepts ont déjà au moins un terme en anglais, nous visons l’exhaustivité ;
  • trouver des définitions (pas encore en place) ;
  • disposer d’identifiants uniques et pérennes (URIs) pour référencer un grand nombre d’objets d’intérêt et méthodes scientifiques d’INRAE depuis des vocabulaires spécifiques développés par nos équipes de recherche

Le thésaurus est consultable en ligne : https://consultation.vocabulaires-ouverts.inrae.fr/thesaurus-inrae/fr/ 

D’ici quelques semaines, le thésaurus sera utilisable via des web services pour être intégré à vos applications et plateformes.

En savoir plus sur le thésaurus et suivre son évolution : https://vocabulaires-ouverts.inrae.fr/a-propos-du-thesaurus-inrae/

Contacter le comité éditorial : thesaurusINRAE@inrae.fr

AsCoPain-T déménage

La Terminologie des descripteurs des pains français (AsCoPain-T) définit les descripteurs qualité utilisés usuellement par les professionnels de la panification et ceux issus des travaux scientifiques.
Pour améliorer sa visibilité et faciliter son accès dans Agroportal, la nouvelle adresse d’AsCoPain-T est désormais http://agroportal.lirmm.fr/ontologies/ASCOPAIN-T   

Son DOI reste https://doi.org/10.15454/1.5077147058936785E12

Thesaurus for Animal Physiology and Livestock Systems

Le thésaurus Triphase décrit finement les axes de recherche du département scientifique Physiologie animale et systèmes d’élevage (Phase) de l’Inra. A l’aide d’outils dédiés, il permet par exemple d’analyser ces axes dans l’ensemble des documents produits par les chercheurs et les ingénieurs du département et référencés dans la base bibliographique ProdInra (Inra).

Les termes de TriPhase ont été utilisés pour analyser la répartition des concepts et leur évolution au cours du temps dans les publications de 2009 à 2013 des chercheurs du département Phase. L’outil d’analyse stratégique ANStrat développé par l’unité Inra MaIAGE permet de formuler des requêtes croisées sur les concepts, les unités, les partenaires, les supports de publication et d’en visualiser les résultats. La navigation interactive à travers la structure de TriPhase permet d’analyser les thématiques à différents niveaux de généralité.

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Animal Health Ontology for Livestock

AHOL (Animal Health Ontology for Livestock) est une ontologie des caractéristiques définissant les problèmes de santé des animaux d’élevage dans leur environnement (EOL) liés à leurs phénotypes (ATOL). AHOL a pour but de :

  • fournir une ontologie de référence des traits de santé des animaux d’élevage pour les communautés scientifiques et éducatives internationales, agriculteurs, etc. ;
  • fournir cette ontologie de référence dans un langage utilisable par les ordinateurs pour par exemple, la gestion des bases de données, l’analyse sémantique et la modélisation ;
  • rendre l’ontologie AHOL aussi opérationnelle que possible et étroitement liée aux techniques de mesure ;
  • structurer l’ontologie en relation avec la production animale

Cette ontologie est en relation avec ATOL et EOL.

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PO² Dairy gels

PO² Dairy Gels est une spécialisation de la Process and Observation Ontology appliquée aux gels laitiers. Elle est utilisée dans des projets de recherche visant à formuler des produits bien équilibrés (par exemple, moins de matières grasses, de sucre et de sel) avec des qualités sensorielles acceptables pour le consommateur tout en utilisant un processus de production respectueux de l’environnement.

[image: ©SLAGMULDER Christian – Inra]

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Woody Plant Ontology

L’ontologie des plantes ligneuses (Woody Plant Ontology) énumère les variables de référence utilisées pour les expérimentations et les observations sur les plantes ligneuses (arbres et arbustes forestiers, et dans certains cas arbres fruitiers). Créée par l’URGI, elle est issue d’une initiative internationale basée sur différentes communautés (française, portugaise et européenne). Les termes sont recueillis auprès de diverses sources et organisés selon la norme Crop Ontology où chaque variable est composée d’un triplet :

  1. un caractère, le caractère étudié,
  2. une méthode, le protocole de mesure et
  3. une échelle, l’unité de mesure ou l’échelle de notation.

[image: ©Jean-Marie BOSSENNEC – Inra] Continuer la lecture

Agri-Food Experiment Ontology (AFEO)

L’Agri-Food Experiment Ontology (AFEO) est une ontologie générique qui modélise la chaîne agro-alimentaire depuis la production de la biomasse jusqu’au produit fini, après transformation. Elle est le résultat de l’intégration et de l’extension de deux ontologies existantes, soit OAE (Agricultural Experiments Ontology) et OFPE (Ontology for Food Processing Experiment) également produites à l’Inra.

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Ontology for Experimental Phenotypic Objects (OEPO)

L’Ontologie des Objets Phénotypiques Expérimentaux (OEPO) permet d’attribuer des types à des objets impliqués dans des expériences de phénotypage. Par exemple, l’organisation et le contexte de l’expérimentation, le type d’environnement, le matériel génétique utilisé, et les objets physiques étudiés. Elle définit également une hiérarchie de spécialisation entre ces objets en fonction des spécificités des installations et des expériences. Continuer la lecture