Archives mensuelles : juillet 2015

Wheat Trait and Phenotype Ontology

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Wheat Trait and Phenotype Ontology (aussi connue sous le nom « Wheat Phenotype » est une ontologie qui décrit les traits du blé tendre (Triticum aestivum) et les facteurs environnementaux qui affectent ces traits. Les traits incluent les traits de résistance aux maladies, de développement, nutritionnels, de qualité boulangère, etc. Les facteurs environnementaux incluent les facteurs biotiques et abiotiques.

Retrouvez toutes les informations sur Wheat Trait and Phenotype Ontology dans Data INRAE: https://doi.org/10.15454/1.4382637738008071E12

Visualisez-la dans AgroPortal : http://agroportal.lirmm.fr/ontologies/WHEATPHENOTYPE

DOI : 10.15454/1.4382637738008071E12

OntoBiotope

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OntoBiotope est une ontologie des habitats des microorganismes. Son principe de modélisation et son lexique reflètent la classification des biotopes utilisée par les biologistes pour décrire les sites d’isolement des microorganismes (p. ex. GenBank, GOLD, ATCC). OntoBiotope est développée et maintenue par le réseau Méta-omiques & écosystèmes microbiens (MEM) auquel participent 30 microbiologistes de l’INRAE (Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement) issus de tous les domaines de la microbiologie appliquée. La pertinence des termes OntoBiotope est évaluée par le moteur de recherche sémantique PubMedBiotope. Il identifie et catégorise les biotopes microbiens dans tous les résumés de PubMed en appliquant la méthode ToMap (Text to Ontology Mapping) à l’ontologie OntoBiotope. Il indexe également 3,35 millions de relations entre les taxons et leurs habitats.

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DOI : 10.15454/1.4382640528105164E12